सामुदायिक-अधिग्रहित निमोनिया के रोगियों में आक्रामक पल्मोनरी एस्परगिलोसिस की नैदानिक ​​विशेषताएं, निदान, परिणाम और फेफड़े का माइक्रोबायोम विश्लेषण

अमूर्त

पृष्ठभूमि

समुदाय-अधिग्रहित निमोनिया (सीएपी) के रोगियों में इनवेसिव पल्मोनरी एस्परगिलोसिस (आईपीए) को कम करके आंका जाता है। इस अध्ययन का उद्देश्य सीएपी रोगियों में आईपीए की नैदानिक ​​​​विशेषताओं और परिणामों का वर्णन करना, आईपीए के लिए मेटागेनोमिक अगली पीढ़ी के अनुक्रमण (एमएनजीएस) के नैदानिक ​​​​प्रदर्शन का आकलन करना और एमएनजीएस डेटा के माध्यम से फेफड़ों के माइक्रोबायोम का विश्लेषण करना है।

हाल ही में, नोवेल कोरोना वायरस निमोनिया महामारी ने दुनिया भर में व्यापक ध्यान आकर्षित किया है। बहुत से लोगों ने इस बात पर ध्यान देना शुरू कर दिया है कि क्या उनकी रोग प्रतिरोधक क्षमता काफी मजबूत है क्योंकि रोग प्रतिरोधक क्षमता बीमारियों के खिलाफ शरीर की पहली रक्षा पंक्ति है। इस लेख में, हम निमोनिया और प्रतिरक्षा के बीच संबंध का पता लगाते हैं।

निमोनिया एक गंभीर श्वसन संक्रमण और सूजन संबंधी बीमारी है जो कई कारणों से होती है। सामान्य सर्दी, फ्लू और नोवेल कोरोना वायरस जैसे वायरस निमोनिया का कारण बन सकते हैं। इस बीमारी का फोकस यह है कि यह श्वसन प्रणाली को अपरिवर्तनीय क्षति पहुंचाती है और श्वसन विफलता का कारण बन सकती है।

हालाँकि, यदि आपकी प्रतिरक्षा पर्याप्त है, तो आपका शरीर वायरस और बैक्टीरिया से लड़ने के लिए बेहतर रूप से सुसज्जित है। यह मुख्य रूप से श्वेत रक्त कोशिकाओं के कारण होता है - जो शरीर में सबसे महत्वपूर्ण प्रतिरक्षा कोशिकाओं में से एक है। श्वेत रक्त कोशिकाएं हमलावर रोगज़नक़ों को पहचान सकती हैं और उन पर सीधे हमला कर सकती हैं, और रोगज़नक़ के आक्रमण से बचाव के लिए एंटीबॉडी का स्राव भी कर सकती हैं।

श्वेत रक्त कोशिकाओं के अलावा, प्रतिरक्षा प्रणाली के कुछ अन्य महत्वपूर्ण घटकों में लिम्फोसाइट्स और फागोसाइटोसिस शामिल हैं। लिम्फोसाइट्स विदेशी रोगजनकों को पहचानकर प्रतिरक्षा प्रणाली को सक्रिय करते हैं, जबकि फागोसाइटोसिस तब होता है जब कुछ प्रकार की श्वेत रक्त कोशिकाएं हमलावर बैक्टीरिया जैसे रोगजनकों को घेर लेती हैं और तोड़ देती हैं।

इसलिए, अपनी प्रतिरक्षा प्रणाली को स्वस्थ रखना निमोनिया जैसे श्वसन संक्रमण को रोकने का एक प्रभावी तरीका है। आप गहरे समुद्र में रहने वाली मछली, नट्स, बीन्स, स्ट्रॉबेरी, ब्लूबेरी आदि जैसे विटामिन, प्रोटीन और एंटीऑक्सीडेंट से भरपूर खाद्य पदार्थ खाकर अपनी प्रतिरक्षा में सुधार कर सकते हैं। इसके अलावा, अच्छा स्वास्थ्य बनाए रखना भी बहुत महत्वपूर्ण है, जिसमें धूम्रपान न करना, अधिक व्यायाम करना, अच्छी नींद बनाए रखना और तनाव कम करना शामिल है।

संक्षेप में, निमोनिया जैसे श्वसन संक्रमण से बचने के लिए, अच्छी प्रतिरक्षा बनाए रखना आवश्यक है। हमें स्वस्थ आहार, उचित व्यायाम और नींद की आदतों के माध्यम से शरीर की प्रतिरक्षा में सुधार करने की आवश्यकता है। अपनी जीवनशैली की उचित योजना बनाएं ताकि आपके शरीर में बेहतर रक्षा तंत्र हो और आप निमोनिया जैसी बीमारियों से दूर रहें। इस दृष्टि से हमें अपनी रोग प्रतिरोधक क्षमता को बेहतर करने की जरूरत है। सिस्टैंच प्रतिरक्षा में काफी सुधार कर सकता है, क्योंकि मांस की राख में विभिन्न प्रकार के जैविक रूप से सक्रिय घटक होते हैं, जैसे पॉलीसेकेराइड, दो मशरूम, हुआंग ली, आदि। ये घटक प्रतिरक्षा प्रणाली को उत्तेजित कर सकते हैं, सिस्टम में विभिन्न प्रकार की कोशिकाओं, उनकी प्रतिरक्षा गतिविधि को बढ़ा सकते हैं।

सिस्टैंच के स्वास्थ्य लाभ पर क्लिक करें

तरीकों

इस पूर्वव्यापी समूह अध्ययन में 22 अप्रैल 2019 से 30 सितंबर 2021 तक सीएपी रोगियों को शामिल किया गया। नैदानिक ​​​​और सूक्ष्मजीवविज्ञानी डेटा का विश्लेषण किया गया। एमएनजीएस के नैदानिक ​​प्रदर्शन की तुलना पारंपरिक पता लगाने के तरीकों से की गई। एमएनजीएस द्वारा पता लगाए गए फेफड़े के माइक्रोबायोम की विशेषता बताई गई और नैदानिक ​​​​विशेषताओं के साथ इसके संबंध का मूल्यांकन किया गया।

मुख्य परिणाम

111 सीएपी रोगियों में से 26 (23.4 प्रतिशत) में आईपीए का निदान किया गया था। आईपीए वाले मरीजों ने बिना आईपीए वाले मरीजों की तुलना में कमजोर प्रतिरक्षा, उच्च अस्पताल मृत्यु दर (30.8 प्रतिशत बनाम 11.8 प्रतिशत), और गहन देखभाल इकाई मृत्यु दर (42.1 प्रतिशत बनाम 17.5 प्रतिशत) प्रदर्शित की। एस्परगिलस एसपीपी का पता लगाने में गैलेक्टोमैनन (जीएम) एंटीजन परीक्षण में सबसे अधिक संवेदनशीलता (57.7 प्रतिशत) थी, इसके बाद एमएनजीएस (42.3 प्रतिशत), कल्चर (30.8 प्रतिशत), और स्मीयर (7.7 प्रतिशत) थे। मग, कल्चर और स्मीयर में 100 प्रतिशत विशिष्टता थी, जबकि जीएम परीक्षण में 92.9 प्रतिशत विशिष्टता थी। आईपीए की माइक्रोबियल संरचना गैर-आईपीए रोगियों से काफी भिन्न थी (पृ<0.001; Wilcoxon test). Nineteen different species were significantly correlated with clinical outcomes and laboratory biomarkers, particularly for Streptococcus salivarius, Prevotella timonensis, and Human betaherpesvirus 5.

निष्कर्ष

हमारे परिणाम बताते हैं कि एस्परगिलस संक्रमण वाले रोगियों में प्रारंभिक मृत्यु दर अधिक होती है। एस्परगिलस संक्रमण के जोखिम वाले रोगियों के निदान में एनजीएस को नियमित सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षणों के पूरक के रूप में सुझाया जा सकता है। फेफड़े का माइक्रोबायोटा आईपीए की सूजन, प्रतिरक्षा और चयापचय स्थितियों से जुड़ा है, और इस प्रकार नैदानिक ​​​​परिणामों को प्रभावित करता है।

परिचय

इनवेसिव पल्मोनरी एस्परगिलोसिस (आईपीए) रुग्णता और मृत्यु दर का एक महत्वपूर्ण कारण है, जो आम तौर पर प्रतिरक्षाविहीन मेजबानों को प्रभावित करता है, जैसे कि एचआईवी संक्रमण वाले रोगियों के साथ-साथ कॉर्टिकोस्टेरॉइड थेरेपी प्राप्त करने वाले रोगी, प्रत्यारोपण प्राप्तकर्ता, या हेमेटोलॉजिकल कैंसर।1 गलत निदान या गलत निदान के कई मामले और चिकित्सा संसाधनों की कमी के कारण केवल पोस्टमॉर्टम का निदान किया जाता है और नए जोखिम कारकों को कम करके आंका जाता है। आईपीए के नैदानिक ​​​​निदान में मेजबान कारक, नैदानिक ​​​​विशेषताएं और माइकोलॉजिकल साक्ष्य शामिल हैं। ऊतक के नमूनों की दुर्गमता, संस्कृति की कम संवेदनशीलता, खराब प्रयोज्यता से उत्पन्न होने वाली समस्याएं पारंपरिक मेजबान कारकों और विशिष्ट नैदानिक ​​​​और रेडियोलॉजिकल निष्कर्षों की अनुपस्थिति के कारण आईपीए रोगियों में देरी और चूक का निदान होता है। फंगल संक्रमण के निदान के लिए हाल ही में प्रकाशित अमेरिकन थोरैसिक सोसाइटी नैदानिक ​​​​अभ्यास दिशानिर्देश संस्कृति-स्वतंत्र नैदानिक ​​​​परीक्षणों पर प्रकाश डालते हैं, जिसमें मजबूत सिफारिशें दी गई हैं। पीसीआर.5 द्वारा ब्रोन्कोएल्वियोलर लैवेज द्रव (बीएएलएफ) में एस्परगिलस डीएनए का पता लगाना।

पिछले दशक में, रोगजनक डीएनए की मात्रा निर्धारित करने और अनुक्रमण के लिए आणविक तरीकों के विकास ने विभिन्न सूक्ष्मजीवों का पता लगाने में काफी सुविधा प्रदान की है। मेटाजेनोमिक नेक्स्ट-जेनरेशन सीक्वेंसिंग (एनजीएस) को अब नैदानिक ​​​​सेटिंग्स में संक्रामक रोगों के निदान के लिए व्यापक रूप से लागू किया गया है, विशेष रूप से गैर-लक्षित दृष्टिकोण में विशिष्ट या अज्ञात या मिश्रित रोगजनकों के साथ। उदाहरण के लिए, पारंपरिक पता लगाने के तरीकों के साथ एमएनजीएस के संयोजन से वृद्धि हो सकती है। माइकोबैक्टीरियम ट्यूबरकुलोसिस कॉम्प्लेक्स7 के लिए पता लगाने की दर और प्रतिरक्षाविहीन गंभीर समुदाय-अधिग्रहित निमोनिया (सीएपी) रोगियों में मिश्रित रोगजनकों का पता लगाने की सुविधा प्रदान करता है। आज तक, फेफड़े के एस्परगिलोसिस संक्रमण का पता लगाने के लिए एनजीएस का नैदानिक ​​प्रदर्शन स्पष्ट नहीं हुआ है।

हाल ही में, कई श्वसन रोगों में फेफड़े के माइक्रोबायोम की संरचना और विविधता में भिन्नता का वर्णन किया गया, जिससे सटीक निदान के लिए नए दृष्टिकोण उपलब्ध हुए। जीवाणुविज्ञानी रूप से पुष्टि किए गए तपेदिक के रोगियों ने नकारात्मक तपेदिक रोगियों की तुलना में जीवाणु प्रजातियों में काफी वृद्धि देखी। 9 संभावित रोगज़नक़ के साथ संवर्धन द्वारा प्रेरित फुफ्फुसीय समुदाय का असंतुलन इंट्यूबेटेड / यंत्रवत् हवादार रोगियों में परिणामों के साथ सहसंबद्ध है। 10 हेरिवॉक्स एट अल ने आईपीए के साथ रोगियों की खोज की विशिष्ट जीवाणु टैक्सा की विभेदक प्रचुरता प्रदर्शित की गई।11

नई नैदानिक ​​तकनीकें उपलब्ध होने से, रोग की व्यापक समझ के लिए नए दृष्टिकोण से आईपीए की नैदानिक ​​विशेषताओं और फेफड़ों के माइक्रोबायोम का मूल्यांकन करना संभव है। यह अध्ययन सीएपी रोगियों में आईपीए की नैदानिक ​​विशेषताओं और परिणामों का वर्णन करने, आईपीए के लिए एमएनजीएस के नैदानिक ​​प्रदर्शन का आकलन करने और आईपीए में नैदानिक ​​विशेषताओं और फेफड़ों के माइक्रोबायोम के बीच संबंध को प्रकट करने के लिए डिज़ाइन किया गया था।

विधि

अध्ययन डिज़ाइन और प्रतिभागी

यह एक पूर्वव्यापी समूह अध्ययन था जिसमें 22 अप्रैल 2019 और 30 सितंबर 2021 के बीच चोंगकिंग मेडिकल यूनिवर्सिटी के पहले संबद्ध अस्पताल में सीएपी के रूप में निदान किए गए अस्पताल में भर्ती मरीजों (18 वर्ष से अधिक या उसके बराबर) को शामिल किया गया था। इस अध्ययन में नामांकित मरीजों को मिलना चाहिए निम्नलिखित समावेशी मानदंड: (1) सीएपी का निदान 2007 आईडीएसए/एटीएस दिशानिर्देशों को पूरा करता है12, (2) ब्रोन्कोएलेवोलर लैवेज से गुजरना, (3) नमूना संग्रह से पहले पिछले 2 सप्ताह में कोई एंटीबायोटिक जोखिम नहीं होना और (4) गैलेक्टोमैनन (जीएम) परीक्षण होना, BALF का स्मीयर, कल्चर और BALF mNGS परिणाम। यूरोपीय संगठन फॉर रिसर्च एंड ट्रीटमेंट ऑफ कैंसर/मायकोसेस स्टडी ग्रुप (ईओआरटीआईसी/एमएसजी) के 2019 मानदंडों के अनुसार, संभावित आईपीए वाले मामलों में बीएएलएफ में कम से कम एक मेजबान कारक, एक नैदानिक ​​​​अभिव्यक्ति और माइकोलॉजिकल साक्ष्य की उपस्थिति की आवश्यकता होती है।3 इस अध्ययन में, नैदानिक ​​मानदंडों में एक संशोधन एनजीएस को जीएम परीक्षण, स्मीयर और कल्चर सहित माइकोलॉजिकल परीक्षण विधियों में से एक के रूप में शामिल किया गया था। संभावित आईपीए के बिना मामलों में नैदानिक ​​या रेडियोलॉजिकल साक्ष्य या बीएएलएफ में एस्परगिलस एसपीपी की उपस्थिति के बिना रोगी शामिल थे। जीवित रहने या मृत्यु की तारीख के बारे में पूछताछ करने के लिए सभी नामांकित मरीजों से टेलीफोन पर संपर्क किया गया।

डेटा संग्रह और सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षण

एक मानकीकृत डेटा संग्रह फॉर्म का उपयोग करके इलेक्ट्रॉनिक मेडिकल रिकॉर्ड से नैदानिक ​​​​जानकारी निकाली गई थी, जिसमें जनसांख्यिकीय जानकारी, नैदानिक ​​​​डेटा, प्रयोगशाला निष्कर्ष, छाती की सीटी, एंटिफंगल उपचार और परिणाम शामिल थे। डेटा सटीकता को सत्यापित करने के लिए दो जांचकर्ताओं द्वारा स्वतंत्र रूप से सभी डेटा की समीक्षा की गई। श्रेणी क्रमसूचक पैमाने13 को अध्ययन डिजाइन के आधार पर संशोधित किया गया था, जिसमें परस्पर अनन्य श्रेणियां शामिल थीं: श्रेणी 7, मृत्यु; श्रेणी 6, जिसमें आक्रामक वेंटिलेशन और अतिरिक्त अंग समर्थन की आवश्यकता होती है (उदाहरण के लिए, निरंतर रीनल रिप्लेसमेंट थेरेपी या एक्स्ट्राकोर्पोरियल झिल्ली ऑक्सीजनेशन); श्रेणी 5, जिसमें आक्रामक यांत्रिक वेंटिलेशन की आवश्यकता होती है; श्रेणी 4, जिसमें गैर-आक्रामक वेंटिलेशन या उच्च-प्रवाह ऑक्सीजन की आवश्यकता होती है; श्रेणी 3, मास्क या नाक के दांतों द्वारा पूरक ऑक्सीजन की आवश्यकता होती है; श्रेणी 2, अस्पताल में भर्ती, कोई ऑक्सीजन नहीं; श्रेणी 1, छुट्टी दे दी गई। नैदानिक ​​स्थिति में सुधार को निश्चित समय बिंदुओं (दिन 1, 7, 14, 21, और 28) पर स्तर क्रमसूचक पैमाने द्वारा मूल्यांकन की गई 2 श्रेणियों की गिरावट के रूप में परिभाषित किया गया था।
सीरम में जीएम एंटीजन और बीएएलएफ में जीएम का परीक्षण आम तौर पर सभी नामांकित रोगियों में किया जाता है। एक परिणाम को सकारात्मक माना जाता था जब ऑप्टिकल इंडेक्स मान सीरम में 1.0 से अधिक या उसके बराबर या BALF में 1.{3}} से अधिक या उसके बराबर या 0 से अधिक या उसके बराबर होता था। सीरम में .7 और BALF में 0.8 से अधिक या उसके बराबर। BALF नमूनों को mNGS, माइक्रोस्कोपी द्वारा स्मीयर और साधारण फंगल कल्चर के अधीन किया गया।

मेटागेनोमिक्स अगली पीढ़ी का अनुक्रमण

मानक प्रक्रियाओं के अनुसार प्रत्येक रोगी से 1.5-3 एमएल BALF एकत्र किया गया था।14 एक 1.5mL माइक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूब जिसमें 0.6mL BALF नमूना, एंजाइम और 1 ग्राम 0 था।5 मिमी कांच के मोतियों को उत्तेजित किया गया था एक भंवर मिक्सर, और एक 0.3mL नमूना को 1.5mL माइक्रोसेंट्रीफ्यूज ट्यूब में अलग किया गया था और निर्माता के मैनुअल का पालन करते हुए TIANamp माइक्रो डीएनए किट (DP316, तियांगेन बायोटेक) का उपयोग करके डीएनए निकाला गया था। डीएनए के माध्यम से 15 डीएनए पुस्तकालयों का निर्माण किया गया था विखंडन, अंतिम मरम्मत, एडाप्टर बंधाव, और पीसीआर प्रवर्धन। फिर, पुष्टि की गई गुणवत्ता वाले पुस्तकालयों को इलुमिना नेक्स्टसेक 550 प्लेटफॉर्म द्वारा 75बीपी (इलुमिना, सैन डिएगो, कैलिफोर्निया, यूएसए) के एकल रीड्स के साथ अनुक्रमित किया गया।16

अद्वितीय आणविक स्पाइक-इन (यूएमएसआई) नामक आंतरिक नियंत्रण को डीएनए निष्कर्षण से पहले नमूने में जोड़ा गया था। विभिन्न नमूनों में यूएमएसआई का क्रम भिन्न-भिन्न था। प्रत्येक एनजीएस परख रन में एक बाहरी नकारात्मक नियंत्रण शामिल था जो नैदानिक ​​​​नमूनों के समानांतर चलता था। विश्लेषण के दौरान, यदि यूएमएसआई अनुक्रम समान था या बाहरी नियंत्रण में कुछ रोगजनकों की रीडिंग बहुत अधिक थी, तो नमूनों के बीच संदूषण पाया जा सकता था।

निम्न-गुणवत्ता वाले रीड्स को हटाकर उच्च-गुणवत्ता वाले अनुक्रमण डेटा उत्पन्न किए गए, इसके बाद बरोज़-व्हीलर संरेखण का उपयोग करके मानव संदर्भ जीनोम (hg19) में मैप किए गए मानव होस्ट अनुक्रमों के कम्प्यूटेशनल घटाव के बाद कम-जटिलता वाले रीड्स को हटाकर शेष डेटा को वर्गीकृत किया गया। एक साथ चार माइक्रोबियल जीनोम डेटाबेस (बैक्टीरिया, कवक, वायरस और परजीवी) को संरेखित करके, जिन्हें राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (ftp://ftp.ncbi. nlm.nih.gov/genomes/) से डाउनलोड किया गया था। मेरे परिणामों की व्याख्या ऑनलाइन पूरक विधियों में देखी जा सकती है।

धैर्यवान एवं जनता की भागीदारी

मरीज़ और जनता इस अध्ययन के डिज़ाइन और संचालन, परिणाम उपायों के चुनाव या भर्ती में शामिल नहीं थे। इस अध्ययन के नतीजे प्रतिभागी और जुड़े समुदायों तक प्रसारित नहीं किए जाएंगे।

सांख्यिकीय आंकड़े

निरंतर चर को माध्यिका (IQR) के रूप में व्यक्त किया गया और मैन-व्हिटनी यू परीक्षण के साथ तुलना की गई। श्रेणीबद्ध चर को संख्याओं (प्रतिशत) के रूप में व्यक्त किया गया और χ2 परीक्षण या फिशर के सटीक परीक्षण द्वारा तुलना की गई। संवेदनशीलता, विशिष्टता, सकारात्मक पूर्वानुमानित मूल्य (पीपीवी), और नकारात्मक पूर्वानुमानित मूल्य (एनपीवी) निर्धारित करने के लिए 2×2 आकस्मिक तालिकाएँ स्थापित की गईं। 0.05 से कम के दो-तरफा को सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण माना जाता था। जब तक अन्यथा संकेत न दिया गया हो, आईबीएम एसपीएसएस सांख्यिकी, वी.23.0 का उपयोग करके सांख्यिकीय विश्लेषण किए गए।

उच्च-गुणवत्ता वाले रीड्स को पहले मानव संदर्भ जीनोम (hg19) में मैप किया गया था और फिर गैर-मानव रीड्स को चार माइक्रोबियल जीनोम डेटाबेस (बैक्टीरिया, कवक, वायरस और परजीवी) से जोड़ा गया था। नकारात्मक नियंत्रणों (ऑनलाइन पूरक तालिका 1) में दिखाई देने वाले पृष्ठभूमि माइक्रोबियल को हटाने के बाद, प्रजातियों की सापेक्ष बहुतायत (ऑनलाइन पूरक तालिका 2) का अनुमान लगाने के लिए बहुतायत के बायेसियन पुन: अनुमान का उपयोग किया गया था। प्रत्येक नमूने के लिए अल्फा विविधता सूचकांक की गणना शैनन और सिम्पसन सूचकांक के आधार पर की गई थी, और बीटा विविधता की गणना भारित यूनीफ्रैक दूरी और ब्रे-कर्टिस दूरी के आधार पर की गई थी। अल्फा और बीटा विश्लेषण के लिए पी मान की गणना विलकॉक्सन रैंक-सम परीक्षण का उपयोग करके की गई थी। रैखिक विभेदक विश्लेषण (एलडीए) प्रभाव आकार का उपयोग समूहों के बीच महत्वपूर्ण रूप से अलग-अलग प्रजातियों को खोजने के लिए किया गया था, जिसमें लॉग 1 {10}} एलडीए स्कोर 2 से अधिक या उसके बराबर और पी मान 0.05 से कम या उसके बराबर था। प्रतिनिधि माइक्रोबायोटा और नैदानिक ​​डेटा के बीच सहसंबंध का मूल्यांकन स्पीयरमैन द्वारा किया गया था।

परिणाम

रोगी भर्ती और नैदानिक ​​विशेषताएं

128 BALF नमूनों वाले कुल 123 रोगियों की समीक्षा की गई और 111 रोगियों को इस अध्ययन में नामांकित किया गया।

छब्बीस रोगियों को संभावित आईपीए (आईपीए नामित) और 85 नियंत्रण बिना आईपीए (नियंत्रण नामित) (चित्र 1) के साथ निदान किया गया था। आईपीए समूह और नियंत्रण समूह के बीच जनसांख्यिकीय और नैदानिक ​​​​विशेषताओं की तुलना को तालिका 1 में संक्षेपित किया गया था। अध्ययन आबादी की औसत आयु 60 (आईक्यूआर, 53-73) वर्ष थी, और 66.7 प्रतिशत पुरुष थे। कुल मिलाकर, 33 रोगियों (29.7 प्रतिशत) का धूम्रपान का इतिहास था। बाईस रोगियों (19.8 प्रतिशत) को क्रॉनिक ऑब्सट्रक्टिव पल्मोनरी डिजीज थी। पंद्रह रोगियों (13.5 प्रतिशत) को कॉर्टिकोस्टेरॉइड्स प्राप्त हुए थे और 36 रोगियों (32.4 प्रतिशत) को प्रतिरक्षाविहीन माना गया था (ऑनलाइन पूरक तालिका 3)। संभावित आईपीए वाले मरीजों में एस्परगिलोसिस के लिए ज्ञात जोखिम कारकों की दर आईपीए के बिना उन लोगों की तुलना में काफी अधिक थी, जिसमें 28 दिनों से अधिक समय तक कॉर्टिकोस्टेरॉइड्स के साथ उपचार (38.5 प्रतिशत बनाम 5.9 प्रतिशत, पी =0। 000) और प्रतिरक्षाविहीनता शामिल थी। स्थिति (53.8 प्रतिशत बनाम 25.9 प्रतिशत, पृष्ठ=0.008)। प्रवेश पर दोनों समूहों के बीच रोगियों के अनुक्रमिक अंग विफलता मूल्यांकन स्कोरिंग और भ्रम, यूरिया, श्वसन दर, रक्तचाप और 65 वर्ष की आयु के स्कोरिंग में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं पाया गया।

माइक्रोबायोलॉजिकल, सीटी छवियां, और प्रयोगशाला निष्कर्ष

26 में से 6 (23.1 प्रतिशत) संभावित आईपीए मामलों के लिए एस्परगिलस फ्यूमिगेटस आइसोलेट्स प्राप्त किए गए, इसके बाद 26 में से 3 (11.5 प्रतिशत) के लिए एस्परगिलस फ्लेवस और 26 में से 1 (3.8 प्रतिशत) के लिए एस्परगिलस यूस्टस प्राप्त किए गए (तालिका 2)। आईपीए में छाती की सीटी पर ब्रोन्कियल दीवार का मोटा होना अधिक बार दिखाया गया था (44। आईपीए रोगियों में कुल लिम्फोसाइट गिनती का स्तर काफी कम है (774.1 बनाम 1088.9, पी=0.009) और लिम्फोसाइट उप-जनसंख्या, जिसमें सीडी3 प्लस टी लिम्फोसाइट गिनती (553.0 बनाम 782.6, शामिल है) पी=0.016), सीडी4 प्लस टी लिम्फोसाइट गिनती (287.9 ​​बनाम 409.5, पी=0.031) और सीडी4− सीडी8− टी लिम्फोसाइट गिनती (25.9 बनाम 45.0, पी=0.007 ) नियंत्रण रोगियों की तुलना में (ऑनलाइन पूरक तालिका 4), आईपीए रोगियों के समझौता किए गए प्रतिरक्षा कार्य को दर्शाता है।

नैदानिक ​​प्रदर्शन की तुलना

संभावित आईपीए वाले मामलों को संभावित आईपीए के बिना मामलों से अलग करने के लिए बीएएलएफ एमएनजीएस और पारंपरिक परीक्षणों के नैदानिक ​​प्रदर्शन की तुलना करने के लिए, परिणाम चित्र 2 में दिखाए गए थे। जीएम परीक्षण (57.7 प्रतिशत) में एस्परगिलस एसपीपी का पता लगाने में सबसे अधिक संवेदनशीलता थी, इसके बाद एमएनजीएस का स्थान था। (42.3 प्रतिशत), कल्चर (30.8 प्रतिशत), और स्मीयर (7.7 प्रतिशत)। स्मीयर की तुलना में, एमएनजीएस में काफी अधिक संवेदनशीलता 42.3 प्रतिशत बनाम 7.7 प्रतिशत, पी=0 थी। एमएनजीएस, कल्चर और स्मीयर में 1{34}}0 प्रतिशत विशिष्टता थी, जबकि जीएम परीक्षण में 92.9 प्रतिशत विशिष्टता थी, जिसमें एमएनजीएस (या कल्चर या स्मीयर) और जीएम परीक्षण (पी{) के बीच महत्वपूर्ण अंतर था। {18}}.029). एस्परगिलस एसपीपी की पहचान के लिए एमएनजीएस, कल्चर और स्मीयर का पीपीवी 100 प्रतिशत था, जबकि जीएम परीक्षण 71.4 प्रतिशत था। एनपीवी को जीएम परीक्षण (87.8 प्रतिशत), एमएनजीएस (85.0 प्रतिशत), कल्चर (82.5 प्रतिशत), और स्मीयर (78.0 प्रतिशत) के रूप में स्थान दिया गया, इन विधियों में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं है। हमने 2019 EORTIC के अनुसार, सीरम बनाम BALF पर GM की संवेदनशीलता/विशिष्टता/PPV/NPV में अंतर का विश्लेषण किया है, 1.0 से अधिक या उसके बराबर के BAL द्रव GM सूचकांक या 1.0 से अधिक या उसके बराबर के सीरम GM सूचकांक को सकारात्मक माना है। /एमएसजी. यह जीएम सीरम की तुलना में संवेदनशीलता में काफी अधिक था लेकिन जीएम बीएएलएफ की विशिष्टता में कम था (क्रमशः 57.7 प्रतिशत बनाम 26.9 प्रतिशत, पी =0.048, 92.9 प्रतिशत बनाम 100 प्रतिशत, 0.029), जो कि दिखाया गया था ऑनलाइन पूरक तालिका 5. पीपीवी और एनपीवी में कोई अंतर नहीं था।

रोग विषयक नतीजे

दोनों समूहों (तालिका 3) के बीच {{0}दिन, 60-दिन, और 90-दिन की मृत्यु दर में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं था। आईपीए समूह में अस्पताल में मृत्यु दर (30.8 प्रतिशत बनाम 11.8 प्रतिशत, पृष्ठ=0.021) और गहन देखभाल इकाई (आईसीयू) मृत्यु दर (42.1 प्रतिशत बनाम 17.5 प्रतिशत, पृष्ठ=0.029) काफी अधिक थी। नियंत्रण समूह की तुलना में. श्रेणी पैमाने की प्रत्येक श्रेणी में आने वाले रोगियों के वितरण ने 28 दिन तक दोनों समूहों के बीच एक सांख्यिकीय अंतर दिखाया (पी=0.017); हालाँकि, सांख्यिकीय परीक्षण का महत्व 1, 7, और 14 दिनों तक श्रेणी क्रमसूचक पैमाने पर नहीं पहुँच सका (चित्र 3)। संभावित आईपीए वाले 23.1 प्रतिशत रोगियों को कई एंटिफंगल दवाएं दी गईं, जबकि संभावित आईपीए के बिना 5.9 प्रतिशत रोगियों को कई एंटीफंगल दवाएं दी गईं (पी=0.01)। संभावित आईपीए वाले मामलों में वोरिकोनाज़ोल प्राप्त करने वाले रोगियों का अनुपात उल्लेखनीय रूप से अधिक था (53.9 प्रतिशत बनाम 8.2 प्रतिशत, पृष्ठ=0।000)। दोनों समूहों (तालिका 3) के बीच एम्फोटेरिसिन बी और कैस्पोफंगिन के उपयोग में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं था।

फेफड़े के माइक्रोबायोम विश्लेषण

आईपीए और नियंत्रण वाले रोगियों में फेफड़े के माइक्रोबियल हस्ताक्षर की समग्र संरचना और विविधता की तुलना करने के लिए, हमने 109 सीएपी रोगियों से एकत्र किए गए बीएएलएफ नमूनों का विश्लेषण किया, जिनमें संभावित आईपीए (नाम) के निदान वाले 24 मामले (एमएनजीएस डेटा के नुकसान के कारण लापता 2 मरीज) शामिल हैं। आईपीए) और संभावित आईपीए (नामित नियंत्रण) के बिना 85 मामले। हमने शैनन और सिम्पसन विविधता सूचकांक का उपयोग करके फेफड़े के समुदायों की विविधता का आकलन किया। महत्वपूर्ण अंतरों के बावजूद गैर-आईपीए रोगियों की तुलना में आईपीए रोगियों में शैनन और सिम्पसन विविधता सूचकांक दोनों में विविधता में कमी आई थी (चित्र 4ए, बी)। भारित यूनीफ्रैक मीट्रिक और ब्रे-कर्टिस मीट्रिक का उपयोग करते हुए, हमने देखा कि आईपीए रोगियों की विविधता गैर-आईपीए रोगियों से काफी भिन्न है (पी)<0.001; Wilcoxon test), suggesting that lung community structure of patients diagnosed with probable IPA differed substantially from those without probable IPA (figure 4C, D). Based on the average relative abundance, we plotted the top 10 phyla, genera, and species among 2 groups. 

समग्र समूह में, फर्मिक्यूट्स, प्रोटीओबैक्टीरिया, एक्टिनोबैक्टीरिया, बैक्टेरोएडेट्स और एस्कोमाइकोटा सबसे प्रचुर फ़ाइला थे, जबकि प्रीवोटेला, स्ट्रेप्टोकोकस, एसिनेटोबैक्टर और न्यूमोसिस्टिस सबसे आम जेनेरा थे (आंकड़ा 5 ए, बी)। न्यूमोसिस्टिस जीरोवेसी, एसिनेटोबैक्टर बाउमानी, लॉट्रोपिया मिराबिलिस, स्ट्रेप्टोकोकस ओरलिस, कोरिनेबैक्टीरियम स्ट्रिएटम, ह्यूमन बीटाहर्पीसवायरस 5, रोथिया म्यूसिलगिनोसा, स्टैफिलोकोकस ऑरियस, प्रीवोटेला मेलानोजेनिक, नोकार्डिया फार्सिनिका जैसी प्रजातियों में शीर्ष 10 की सापेक्ष बहुतायत, केवल एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 के साथ थी। दो समूहों के बीच काफी भिन्न (चित्र 5सी)। आईपीए में विभिन्न प्रजातियों पर उनके नियंत्रण की तुलना में ध्यान केंद्रित करने पर, हमें एलडीए स्कोर 2 और पी से अधिक या उसके बराबर वाली 21 प्रजातियां मिलीं।<0.05, which H. betaherpesvirus 5, A. fumigatus, Aspergillus niger, Citrobacter braakii, Bacillus thermoamylovorans, Helcococcus kunzite, Lactobacillus delbrueckii, Burkholderia dolosa, Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Riemerella anatipestifer, Corynebacterium halotolerant, and Lactobacillus plantarum were significantly abundant in the cases diagnosed with probable IPA, and Streptococcus salivarius, Citrobacter freundii, Paraburkholderia fungorum, Dolosigranulum program, Prevotella timonensis, Sphingobium yanoikuyae, Serratia marcescens, and Corynebacterium oculi were enriched in cases without probable IPA (figure 5D, online supplemental figure 1).

नैदानिक ​​​​डेटा और आईपीए के फेफड़े के माइक्रोबायोटा के बीच सहसंबंध की आगे की जांच करने के लिए, हमने नैदानिक ​​​​परिणामों और प्रयोगशाला निष्कर्षों (चित्रा 6 ए) के साथ 21 अलग-अलग प्रजातियों पर स्पीयरमैन का रैंक-आधारित सहसंबंध परीक्षण किया। हमने देखा कि 19 अलग-अलग प्रजातियां 7 नैदानिक ​​​​परिणामों और 22 प्रयोगशाला बायोमार्कर के साथ महत्वपूर्ण रूप से सहसंबद्ध थीं, विशेष रूप से एस. सालिवेरियस, पी. सिनेंसिस, और एच. बीटाहर्पीसवायरस 5. एस. सालिवेरियस मुख्य रूप से लाल रक्त कोशिकाओं सहित आठ प्रयोगशाला बायोमार्करों के साथ सकारात्मक रूप से सहसंबद्ध थी। लिम्फोसाइट्स, टी लिम्फोसाइट्स, टी हेल्पर कोशिकाएं, साइटोटॉक्सिक टी लिम्फोसाइट्स, बी लिम्फोसाइट्स, सीरम पोटेशियम और एल्ब्यूमिन, और एस्पार्टेट एमिनोट्रांस्फरेज़, डायरेक्ट बिलीरुबिन और डी-डिमर के साथ नकारात्मक रूप से सापेक्ष। जबकि, एस. सालिवेरियस मुख्य रूप से 11 नैदानिक ​​​​परिणामों के साथ नकारात्मक रूप से जुड़ा हुआ था, जिसमें आईसीयू मृत्यु दर, आईसीयू में रहने की अवधि, अस्पताल में मृत्यु, 28 दिन में मृत्यु दर, और 28 दिनों के भीतर पूरक ऑक्सीजन स्वतंत्रता का समय शामिल था, और सकारात्मक रूप से अस्पताल में रहने की अवधि के साथ मृत्यु दर से संबंधित था। 28वें दिन, 28 दिनों के भीतर वेंटीलेटर-मुक्त दिन और नैदानिक ​​स्थिति में सुधार का समय। एस सालिवेरियस के समान, पी. टिमोनेंसिस मुख्य रूप से छह प्रयोगशाला बायोमार्कर के सापेक्ष सकारात्मक था, जिसमें कुल लिम्फोसाइट्स, टी लिम्फोसाइट्स, टी हेल्पर कोशिकाएं, सीडी4− सीडी8− टी कोशिकाएं, बी लिम्फोसाइट्स और सीरम पोटेशियम शामिल थे, और प्रोकैल्सिटोनिन के साथ नकारात्मक रूप से सहसंबद्ध था।

समान रूप से, पी. टिमोनेंसिस मुख्य रूप से आईसीयू में रहने की अवधि और अस्पताल में मृत्यु दर के साथ नकारात्मक रूप से जुड़ा था, लेकिन 28 दिनों के भीतर वेंटिलेटर-मुक्त दिनों के साथ सकारात्मक रूप से जुड़ा था। एस. सालिवेरियस और पी. सिनेंसिस के विपरीत, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 छह प्रयोगशाला बायोमार्कर के साथ नकारात्मक रूप से जुड़ा हुआ था, जिसमें कुल लिम्फोसाइट्स, टी लिम्फोसाइट्स, टी हेल्पर कोशिकाएं, सीडी4 प्लस सीडी8 प्लस टी कोशिकाएं, बी लिम्फोसाइट्स और सीरम पोटेशियम शामिल थे, और सकारात्मक सापेक्ष था। रक्त यूरिया नाइट्रोजन। इस बीच, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 मुख्य रूप से आईसीयू में रहने की अवधि और 28 दिनों के भीतर पूरक ऑक्सीजन स्वतंत्रता के समय के साथ नकारात्मक रूप से संबंधित था। इन अवलोकनों से पता चला कि फेफड़े में माइक्रोबियल समुदायों की डिस्बिओसिस रोगी की पैथोफिजियोलॉजिकल स्थितियों से जुड़ी है और इस प्रकार नैदानिक ​​​​परिणामों को प्रभावित कर सकती है।

21 महत्वपूर्ण रूप से भिन्न प्रजातियों के नैदानिक ​​​​प्रभाव की आगे की जांच करने के लिए, हमने संचयी संभाव्यता वक्र की साजिश रचकर अस्तित्व विश्लेषण किया। जैसा कि चित्र 6बी, और सी में दिखाया गया है, ए. फ्यूमिगेटस और एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 का पता लगाने से आईसीयू के खराब परिणामों का काफी हद तक पूर्वानुमान लगाया जा सकता है (पी=0.045, 0.032) . जबकि चित्र 6डी, ई में, हमने पाया कि एस. सालिवेरियस और पी. टिमोनेंसिस का पता लगाना आईसीयू परिणामों में सुधार का बेहद महत्वपूर्ण पूर्वानुमान था (पी=0.0031, 0.0054)। इस प्रकार हमने निष्कर्ष निकाला कि सीएपी के फेफड़े के माइक्रोबायोटा में, आईसीयू परिणामों की भविष्यवाणी सामुदायिक संरचना, विशेष रूप से ए. फ्यूमिगेटस, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5, एस. सालिवेरियस, और पी. सिनेंसिस द्वारा की जा सकती है।

बहस

इस पूर्वव्यापी समूह अध्ययन में, हमने आईपीए की नैदानिक ​​विशेषताओं की जांच की। दिलचस्प बात यह है कि हमने देखा कि संभावित एस्परगिलस संक्रमण के रूप में वर्गीकृत रोगियों में नियंत्रण की तुलना में अस्पताल में मृत्यु दर (30.8 प्रतिशत) और आईसीयू मृत्यु दर (42.1 प्रतिशत) काफी अधिक थी। 28वें दिन की मृत्यु दर, हालांकि सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण नहीं है, नियंत्रण की तुलना में आईपीए रोगियों में संख्यात्मक रूप से अधिक थी। इन आंकड़ों से पता चलता है कि एस्परगिलस संक्रमण वाले रोगियों में प्रारंभिक मृत्यु दर अधिक होती है। पिछले अध्ययन में आईसीयू मृत्यु दर का अनुमान 45 प्रतिशत और अस्पताल मृत्यु दर 26 प्रतिशत बताया गया था। आईपीए की एक दुर्लभ इकाई, इनवेसिव ट्रेकोब्रोनचियल एस्परगिलोसिस के बीच, {{8}दिन और 90-दिन की मृत्यु दर दोनों 90 प्रतिशत तक अधिक थी। 19 लॉफलिन एट अल ने बताया कि संभावित एस्परगिलस संक्रमण वाले रोगियों में आईसीयू मृत्यु दर एस्परगिलस संक्रमण के बिना रोगियों की तुलना में काफी अधिक नहीं थी,4 जो संभवतः आईसीयू सेटिंग में वेंटिलेटर से जुड़े निमोनिया रोगी समूह में आम तौर पर गंभीर स्थिति के कारण है। इस अध्ययन में, सीएपी के साथ नामांकित रोगियों की समग्र स्थिति अपेक्षाकृत हल्की थी, जो एस्परगिलस संक्रमण से उल्लेखनीय रूप से बढ़ सकती है और संभावित रूप से जीवन के लिए खतरा हो सकती है।

कॉर्निलेट एट अल ने सुझाव दिया है कि आईपीए रोगियों की गैर-विशिष्ट नैदानिक ​​​​विशेषताएं और नैदानिक ​​कठिनाइयां, विशेष रूप से जब न्यूट्रोपेनिया के बिना रोगियों को आसानी से उप-इष्टतम प्रबंधन और उपचार की शुरुआत में देरी होती है, जिसके परिणामस्वरूप उच्च मृत्यु दर और रुग्णता होती है। 20 आईपीए के रोगियों की विनाशकारी मृत्यु दर को देखते हुए, समय पर और रुग्णता और मृत्यु दर को कम करने के लिए प्रभावी एंटीफंगल उपचार के लिए सटीक निदान पर प्रकाश डाला गया है और इसकी तत्काल आवश्यकता है। पिछले दशक में, आईपीए के निदान में जीएम का पता लगाने का व्यापक रूप से उपयोग किया गया है। हालांकि, सीरम नमूनों के लिए जीएम परीक्षण में गैर-न्यूट्रोपेनिक मेजबानों में आईपीए के निदान में सीमित संवेदनशीलता है। इसके बजाय, रोगियों के बीएएल द्रव नमूनों में जीएम का पता लगाना आईपीए के जोखिम में उत्कृष्ट नैदानिक ​​सटीकता होती है, 23 24 क्योंकि जीएम सीरम की तुलना में बीएएल द्रव में पहले और उच्च सांद्रता में जारी होता है।25 हाल ही में, एमएनजीएस फंगल रोगों के निदान में तेजी से महत्वपूर्ण भूमिका निभा रहा है। डिंग एट अल ने प्रदर्शित किया कि कैंडिडा अल्बिकन्स का पता लगाने में एमएनजीएस की संवेदनशीलता संस्कृति की तुलना में काफी अधिक थी। 9 इस अध्ययन में, BALF को सीधे निचले श्वसन पथ से एकत्र किया गया, जिससे मौखिक माइक्रोबायोटा से संदूषण से बचा जा सका। BALF में एस्परगिलस का पता mNGS, कल्चर, स्मीयर और GM परीक्षण द्वारा लगाया गया। परिणामों से पता चला कि एनजीएस में एस्परगिलस का पता लगाने में संस्कृति के लिए तुलनीय विशिष्टता और पीपीवी थी। हालाँकि mNGS की संवेदनशीलता GM परीक्षण से कम थी, mNGS ने स्मीयर की तुलना में अधिक संवेदनशीलता और सीरम और BALF GM परीक्षणों की तुलना में अधिक विशिष्टता दिखाई। इन परिणामों ने संकेत दिया कि एमएनजीएस एस्परगिलस का पता लगाने के लिए एक उपयोगी गैर-संस्कृति-आधारित परीक्षण के रूप में कार्य करता है, जो आईपीए के जोखिम वाले रोगियों के निदान में नियमित सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षणों के पूरक का सुझाव देता है।

हमारे अध्ययन से पता चला कि एस्परगिलस वाले सीएपी रोगियों में प्रतिरक्षाविहीन स्थिति और कॉर्टिकोस्टेरॉइड उपचार के कारण बैक्टीरिया या (और) वायरल संक्रमण से संक्रमित होने की अधिक संभावना थी। इन्फ्लूएंजा के जिन मरीजों की रोग प्रतिरोधक क्षमता कमजोर थी, उनमें आईपीए की घटना 32 प्रतिशत तक अधिक पाई गई, जबकि, गैर-प्रतिरक्षा क्षमता वाले इन्फ्लूएंजा मामले समूह में, घटना 14 प्रतिशत थी। 18 कोविड महामारी के उद्भव के साथ और गंभीर सीओवीआईडी ​​​​{5}}, 26 सीओवीआईडी ​​​​-19- से जुड़े फुफ्फुसीय एस्परगिलोसिस (सीएपीए) वाले रोगियों में कॉर्टिकोस्टेरॉइड्स का उपयोग कई मामलों की रिपोर्ट में बताया गया है। 27-29 एक मेटा-विश्लेषण में, सीएपीए की घटना और मृत्यु दर आईसीयू में क्रमशः 10.2 प्रतिशत और 54.9 प्रतिशत होने का अनुमान लगाया गया था।30

एमएनजीएस डेटा में विशाल माइक्रोबियल रीडिंग के कारण जिसका उपयोग कई बीमारियों में माइक्रोबियल हस्ताक्षरों का विश्लेषण करने के लिए किया जा सकता है, हमारे अध्ययन ने एमएनजीएस डेटा का विश्लेषण करके आईपीए रोगियों और गैर-आईपीए सीएपी रोगियों के बीच माइक्रोबायोम की संरचना और संरचना में अंतर का पता लगाने का प्रयास किया। हमारे वर्तमान अध्ययन में 24 आईपीए रोगियों और 85 गैर-आईपीए सीएपी रोगियों के फेफड़े के माइक्रोबायोटा शामिल थे। सभी 109 सीएपी रोगियों के लिए विभिन्न माइक्रोबायोटा और नैदानिक ​​​​डेटा के बीच संबंध की जांच की गई। अल्फा विविधता के लिए, आईपीए रोगियों और गैर-आईपीए सीएपी रोगियों में माइक्रोबायोटा के शैनन सूचकांक और सिम्पसन सूचकांक में कोई महत्वपूर्ण अंतर नहीं थे, यह दर्शाता है कि समुदायों की नमूना विविधता आईपीए रोगियों और गैर-आईपीए रोगियों के बीच समान थी।

बीटा विविधता के लिए, हमारे परिणामों ने आईपीए और गैर-आईपीए के बीच भारित यूनीफ्रैक दूरी (पी=2.1×10−6) और ब्रे-कर्टिस दूरी (पी=0.033) में एक नाटकीय अंतर प्रदर्शित किया। सीएपी रोगी, आईपीए से निदान रोगियों में फेफड़ों के माइक्रोबायोटा संरचना पर एस्परगिलस एसपीपी के संभावित प्रभाव का संकेत देते हैं। इसी तरह के अध्ययनों ने आईपीए और नियंत्रणों के बीच माइक्रोबायोटा की बीटा विविधता में महत्वपूर्ण अंतर दिखाया है। ऐसा इसलिए हो सकता है क्योंकि नियंत्रण में प्रेरक एजेंट जटिल थे, जो कोई भी सीएपी रोगजनक (जैसे बैक्टीरिया, वायरस, कवक, परजीवी और यहां तक ​​​​कि) भी हो सकते हैं। एस्परगिलस को छोड़कर) असामान्य रोगज़नक़। इस प्रकार नियंत्रण में फेफड़ों की माइक्रोबियल विविधता आईपीए से अधिक थी। इस बीच, इन अध्ययनों से पता चला कि फर्मिक्यूट्स, प्रोटीनोबैक्टीरिया, एक्टिनोबैक्टीरिया और बैक्टेरोइडेट्स आईपीए समूह में सबसे प्रचुर मात्रा में फ़ाइला थे। हालांकि, बैक्टीरिया से परे, हमारे अध्ययन में पाया गया कि एस्कोमाइकोटा की सापेक्ष प्रचुरता फ़ाइलम के स्तर में भी अधिक थी, क्योंकि मेटागेनोमिक्स बैक्टीरिया, कवक, वायरस और परजीवियों सहित माइक्रोबायोटा के लगभग सभी न्यूक्लिआई एसिड का संचयन कर सकता है।

महत्वपूर्ण रूप से भिन्न प्रजातियाँ, विशेष रूप से एस. सालिवेरियस, पी. सिनेंसिस, और एच. बीटाहर्पीसवायरस 5, नैदानिक ​​​​डेटा से दृढ़ता से संबंधित थीं। एस. सालिवेरियस और पी. टिमोनेंसिस टी लिम्फोसाइट्स जैसे प्रयोगशाला बायोमार्कर से सकारात्मक रूप से संबंधित थे और अस्पताल में मृत्यु दर जैसे नैदानिक ​​​​परिणामों से नकारात्मक रूप से संबंधित थे। जबकि, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 टी लिम्फोसाइट्स जैसे प्रयोगशाला बायोमार्कर से नकारात्मक रूप से संबंधित था और अस्पताल में मृत्यु दर जैसे नैदानिक ​​​​परिणामों से सकारात्मक रूप से संबंधित था। पिछले अध्ययनों से पता चला है कि एस. सालिवेरियस एक प्रोबायोटिक जीवाणु है जो ग्रसनी उपकला कोशिकाओं में न्यूमोकोकल के जुड़ाव को रोक सकता है।31 इसके अलावा, एक अन्य अध्ययन ने साबित किया है कि एस. सालिवेरियस आइसोलेट्स में हीमोफिलस इन्फ्लुएंजा, मोराक्सेला कैटरलिस, स्ट्रेप्टोकोकस न्यूमोनिया के विकास को रोकने की बेहतर क्षमता थी। स्ट्रेप्टोकोकस पाइोजेन्स, और स्टैफिलोकोकस ऑरियस। 32 ये सभी अध्ययन हमारे अध्ययन से मेल खाते हैं कि एस. सालिवेरियस का रोगियों के बेहतर नैदानिक ​​​​परिणामों के साथ सकारात्मक संबंध था।

एस. सालिवेरियस का संभावित तंत्र रोगियों के बेहतर परिणाम के साथ सकारात्मक रूप से सहसंबद्ध है, यह हो सकता है कि वे संभावित रोगज़नक़ के विकास को रोक सकते हैं और मेजबान प्रतिरक्षा प्रणाली को सक्रिय कर सकते हैं। पी. साइनेंसिस के लिए, एक पिछले अध्ययन से पता चला है कि पी. टिमोनेंसिस त्रि-आयामी एंडोमेट्रियल एपिथेलियल सेल मॉडल में झिल्ली से जुड़े म्यूकिन्स की अभिव्यक्ति को नाटकीय रूप से प्रेरित कर सकता है और एपिथेलियल सतह में बायोफिल्म का निर्माण कर सकता है, जो बदले में अन्य बैक्टीरिया के आसंजन को प्रभावित करता है। .33 रोगियों के बेहतर नैदानिक ​​​​परिणाम के साथ सकारात्मक सहसंबंध का कारण फेफड़े में पी. साइनेंसिस का उपनिवेशण प्रतिरोध और मेजबान प्रतिरक्षा प्रणाली की सक्रियता हो सकता है। नैदानिक ​​सेटिंग्स में, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 स्वस्थ लोगों में जीवन भर के लिए गुप्त संक्रमण पैदा कर सकता है। हालाँकि, एक बार प्रतिरक्षा से समझौता हो जाने पर, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 को पुनः सक्रिय किया जा सकता है, उदाहरण के लिए, ठोस अंग प्रत्यारोपण प्राप्तकर्ताओं और एचआईवी पॉजिटिव रोगियों में।34 इस प्रकार, एच. बीटाहर्पीसवायरस 5 के पुनर्सक्रियन ने कमजोर प्रतिरक्षा प्रणाली और आईपीए रोगियों के खराब नैदानिक ​​​​परिणामों का संकेत दिया है। .

हमारे अध्ययन की अनेकों सीमाएं हैं। सबसे पहले, पूर्वव्यापी अध्ययन को एकत्रित डेटा का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया था और यह अपेक्षाकृत छोटे नमूना आकार तक सीमित था, जो अधूरी जानकारी से पूर्वाग्रह का परिचय दे सकता था। दूसरा, यह अवलोकन अध्ययन था। यद्यपि हमें फेफड़े के माइक्रोबायोटा और नैदानिक ​​​​डेटा के बीच कुछ दिलचस्प सहसंबंध मिले, कारण संबंध को एक संभावित समूह अध्ययन या तंत्र प्रयोग, जैसे कि एक पशु प्रयोग, द्वारा हल करने की आवश्यकता है, जो हमारे अध्ययन का अगला चरण होगा। अन्यथा, अध्ययन ने नए ईओआरटीआईसी/एमएसजी 2019 नैदानिक ​​मानदंडों के आधार पर संभावित एस्परगिलस संक्रमण वाले रोगियों की पहचान की, इसलिए कुछ मामले क्लासिक मेजबान कारकों की अनुपस्थिति के कारण संभावित आईपीए निदान के मानदंडों को पूरा नहीं कर सके।

योगदानकर्ताओं

अध्ययन अवधारणा और डिज़ाइन: YL, ZA, और HX। डेटा का अधिग्रहण: ZA, ML, HL, और MD। डेटा का विश्लेषण और व्याख्या: ZA और HX। पांडुलिपि का प्रारूपण: ZA, HX, और YL। महत्वपूर्ण बौद्धिक सामग्री के लिए पांडुलिपि का महत्वपूर्ण संशोधन: एचएक्स, जेडए, और वाईएल। सांख्यिकीय विश्लेषण: ZA, HL, और HX। प्रशासनिक, तकनीकी, या सामग्री समर्थन: एचएक्स, एचएल, और वाईएल। सभी लेखकों ने लेख में योगदान दिया और प्रस्तुत संस्करण को मंजूरी दी।

अनुदान

चूंगचींग चिकित्सा वैज्ञानिक अनुसंधान परियोजना (चूंगचींग स्वास्थ्य आयोग और विज्ञान और प्रौद्योगिकी ब्यूरो की संयुक्त परियोजना (2022जीडीआरसी010))।

प्रतिस्पर्धी रुचियां

किसी ने घोषणा नहीं की.

धैर्यवान एवं जनता की भागीदारी

मरीज़ और/या जनता इस शोध के डिज़ाइन, संचालन, रिपोर्टिंग या प्रसार योजनाओं में शामिल नहीं थे।

प्रकाशन के लिए रोगी की सहमति

लागू नहीं।

नीति अनुमोदन

इस अध्ययन में मानव प्रतिभागी शामिल हैं। इस अध्ययन को चोंगकिंग मेडिकल अस्पताल के पहले संबद्ध अस्पताल की नैतिक समिति (अनुमोदित संख्या 2021-301) द्वारा अनुमोदित किया गया था। प्रतिभागियों ने भाग लेने से पहले अध्ययन में भाग लेने के लिए सूचित सहमति दी।

उत्पत्ति और सहकर्मी समीक्षा

कमीशन नहीं किया गया; बाह्य रूप से सहकर्मी-समीक्षा की गई।

डेटा उपलब्धता विवरण

अध्ययन से संबंधित सभी डेटा लेख में शामिल किए गए हैं या ऑनलाइन पूरक जानकारी के रूप में अपलोड किए गए हैं।

पूरक सामग्री

यह सामग्री लेखक(लेखकों) द्वारा प्रदान की गई है। बीएमजे पब्लिशिंग ग्रुप लिमिटेड (बीएमजे) द्वारा इसकी जांच नहीं की गई है और हो सकता है कि इसकी सहकर्मी-समीक्षा भी न की गई हो। चर्चा की गई कोई भी राय या सिफारिशें पूरी तरह से लेखक की हैं और बीएमजे द्वारा समर्थित नहीं हैं। बीएमजे सामग्री पर किसी भी निर्भरता से उत्पन्न होने वाले सभी दायित्व और जिम्मेदारी को अस्वीकार करता है। जहां सामग्री में कोई भी अनुवादित सामग्री शामिल है, बीएमजे अनुवाद की सटीकता और विश्वसनीयता की गारंटी नहीं देता है (स्थानीय नियमों, नैदानिक ​​​​दिशानिर्देशों, शब्दावली, दवा के नाम और दवा की खुराक सहित, लेकिन इन्हीं तक सीमित नहीं है), और किसी भी त्रुटि और/के लिए जिम्मेदार नहीं है। या अनुवाद और अनुकूलन या अन्यथा से उत्पन्न होने वाली चूक।

खुला एक्सेस

यह क्रिएटिव कॉमन्स एट्रिब्यूशन नॉन-कमर्शियल (CC BY-NC 4.0) लाइसेंस द्वारा वितरित एक ओपन-एक्सेस लेख है, जो दूसरों को गैर-व्यावसायिक रूप से इस काम को वितरित करने, रीमिक्स करने, अनुकूलित करने, बनाने की अनुमति देता है, और अपने व्युत्पन्न कार्यों को अलग-अलग शर्तों पर लाइसेंस देते हैं, बशर्ते कि मूल कार्य को उचित रूप से उद्धृत किया गया हो, उचित क्रेडिट दिया गया हो, किए गए किसी भी बदलाव का संकेत दिया गया हो और उपयोग गैर-व्यावसायिक हो। http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4 देखें।

प्रतिक्रिया दें संदर्भ

1 टैकोन एफएस, वैन डेन एबीले एएम, बुल्पा पी, एट अल। गंभीर रूप से बीमार रोगियों में आक्रामक एस्परगिलोसिस की महामारी विज्ञान: नैदानिक ​​​​प्रस्तुति, अंतर्निहित स्थितियां और परिणाम। क्रिट केयर 2015;19:7.

2 डैनियन एफ, राउज़ौड सी, ड्यूरॉल्ट ए, एट अल। आक्रामक एस्परगिलोसिस के इतने सारे मामले क्यों छूट जाते हैं? मेडिकल माइकोलॉजी 2019;57:एस94-103।

3 डोनेली जेपी, चेन एससी, कॉफ़मैन सीए, एट अल। यूरोपियन ऑर्गनाइजेशन फॉर रिसर्च एंड ट्रीटमेंट ऑफ कैंसर और मायकोसेस स्टडी ग्रुप एजुकेशन एंड रिसर्च कंसोर्टियम से आक्रामक फंगल रोग की सर्वसम्मति परिभाषाओं का संशोधन और अद्यतन। क्लिन इन्फेक्ट डिस 2020;71:1367-76।

4 लॉफलिन एल, हेलियर टीपी, व्हाइट पीएल, एट अल। यूके आईसीयू में संदिग्ध वेंटिलेटर से जुड़े निमोनिया वाले रोगियों में पल्मोनरी एस्परगिलोसिस। एम जे रेस्पिर क्रिट केयर मेड 2020;202:1125-32।

5 हेज सीए, कार्मोना ईएम, इवांस एसई, एट अल। चिकित्सकों के लिए सारांश: फुफ्फुसीय और महत्वपूर्ण देखभाल अभ्यास में फंगल संक्रमण के निदान में सूक्ष्मजीवविज्ञानी प्रयोगशाला परीक्षण। इतिहास एटीएस 2019;16:1473-7।

6 मिशेल एसएल, सिमनेर पीजे। क्लिनिकल माइक्रोबायोलॉजी में अगली पीढ़ी का अनुक्रमण: क्या हम अभी तक वहाँ हैं? क्लिन लैब मेड 2019;39:405-18।

7 लियू एक्स, चेन वाई, ओयांग एच, एट अल। ब्रोन्कोएल्वियोलर लैवेज द्रव पर मेटागेनोमिक अगली पीढ़ी के अनुक्रमण द्वारा तपेदिक का निदान: एक क्रॉस-अनुभागीय विश्लेषण। इंट जे इंफेक्ट डिस 2021;104:50-7।

8 सन टी, वू एक्स, कै वाई, एट अल। प्रतिरक्षाविहीन वयस्कों में गंभीर समुदाय-अधिग्रहित निमोनिया के रोगजनक निदान और एंटीबायोटिक प्रबंधन के लिए मेटागेनोमिक अगली पीढ़ी का अनुक्रमण। फ्रंट सेल इंफेक्ट माइक्रोबायोल 2021;11:661589।

9 डिंग एल, लियू वाई, वू एक्स, एट अल। पैथोजन मेटागेनोमिक्स बैक्टीरियोलॉजिकल रूप से पुष्टि किए गए और नकारात्मक तपेदिक रोगियों के बीच अलग-अलग फेफड़े के माइक्रोबायोटा हस्ताक्षरों का खुलासा करता है। फ्रंट सेल इंफेक्ट माइक्रोबायोल 2021;11:708827।

10 डिक्सन आरपी, शुल्त्स एमजे, वैन डेर पोल टी, एट अल। फेफड़े का माइक्रोबायोटा गंभीर रूप से बीमार रोगियों में नैदानिक ​​​​परिणामों की भविष्यवाणी करता है। एम जे रेस्पिर क्रिट केयर मेड 2020;201:555-63।

11 हेरिवॉक्स ए, विलिस जेआर, मर्सिएर टी, एट अल। फेफड़े का माइक्रोबायोटा आक्रामक फुफ्फुसीय एस्परगिलोसिस और प्रतिरक्षाविहीन रोगियों में इसके परिणाम की भविष्यवाणी करता है। थोरैक्स 2022;77:283-91।

12 मैंडेल एलए, वंडरिंक आरजी, एंज़ुएटो ए, एट अल। संक्रामक रोग सोसायटी ऑफ अमेरिका/अमेरिकन थोरैसिक सोसायटी वयस्कों में समुदाय-अधिग्रहित निमोनिया के प्रबंधन पर आम सहमति दिशानिर्देश। क्लिन इन्फेक्ट डिस 2007;44 सप्ल 2:एस27-72।

13 वांग वाई, फैन जी, हॉर्बी पी, एट अल। मौसमी इन्फ्लूएंजा ए या बी वायरस संक्रमण के साथ अस्पताल में भर्ती वयस्कों के तुलनात्मक परिणाम: श्रेणी क्रमसूचक पैमाने का अनुप्रयोग। ओपन फोरम इंफेक्ट डिस 2019;6:ofz053।

14 चेन एक्स, डिंग एस, लेई सी, एट अल। निमोनिया में रक्त और ब्रोन्कोएल्वियोलर लैवेज द्रव मेटागेनोमिक अगली पीढ़ी का अनुक्रमण। कैन जे इन्फेक्ट डिस मेड माइक्रोबायोल 2020;2020:6839103।

15 लॉन्ग वाई, झांग वाई, गोंग वाई, एट अल। आईसीयू रोगियों में अगली पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीक द्वारा कोशिका-मुक्त डीएनए के साथ सेप्सिस का निदान। आर्क मेड रेस 2016;47:365-71।

For more information:1950477648nn@gmail.com