मूत्र कोशिकाओं की एकल-कोशिका आरएनए अनुक्रमण से सीओवीआईडी ​​​​में विशिष्ट सेलुलर विविधता का पता चलता है -19-एसोसिएटेड एकेआई

बहस

इस अध्ययन की एक सीमा नमूना लिए गए रोगियों की कम संख्या है। अन्य कारकों को नियंत्रित करने के लिए नमूना संग्रह को नए अस्पताल में प्रवेश तक ही सीमित रखा गया था, जैसे कि COVID के उपचार के रूप में उपयोग की जाने वाली विभिन्न दवाएं। अस्पताल में भर्ती COVID के साथ और बिना AKI वाले मरीजों का उपयोग नियंत्रण के रूप में किया गया क्योंकि स्वस्थ नियंत्रण मूत्र में कई कोशिकाओं का स्राव नहीं करते हैं। अनुक्रमण से पहले मूत्र को संसाधित करना एक अतिरिक्त सीमा है; हालाँकि, इससे प्राप्त जीवित कोशिकाओं के अनुपात में काफी वृद्धि हुई। यहां, संक्रमित रोगियों के मूत्र में कोशिकाओं का आसानी से पता लगाया जा सकता थागुर्दे की चोट. यह महत्वपूर्ण है क्योंकि अधिकांश scRNAseq अध्ययनों ने इसी पर ध्यान केंद्रित किया हैक्षतिग्रस्त गुर्दे, जिससे असंक्रमित किडनी कोशिकाओं का अध्ययन करने के लिए कुछ डेटासेट उपलब्ध हो गए।अकीइसके कई अलग-अलग कारण हैं, और केवल एक उपसमूह ही इसके कारण हो सकता हैप्रत्यक्ष गुर्दे का संक्रमणSARS-CoV-2 द्वारा, जिससे COVID में AKI के बारे में व्यापक निष्कर्ष निकालना मुश्किल हो गया है-19। इसके अतिरिक्त, यह संभव है कि गुर्दे की कोशिकाओं का प्रत्यक्ष वायरल संक्रमण इस अध्ययन में दर्ज संक्रमण प्रक्रिया की तुलना में बाद में होता है। बाद के अध्ययनों से पहले, दौरान और बीमारी के दौरान लिए गए अनुक्रमिक नमूनों के साथ पूरी बीमारी के दौरान मूत्र कोशिका परिवर्तनों की जांच की जाएगीएकेआई के बाद.

किडनी रोग के रोगियों के स्वास्थ्य के लिए जैविक जड़ी-बूटियाँ

हमने अस्पताल में भर्ती COVID के रोगियों के मूत्र तलछट पर scRNAseq का सफलतापूर्वक प्रदर्शन किया। इसने AKI के दौरान होने वाले सेलुलर परिवर्तनों के गैर-आक्रामक अध्ययन की अनुमति दी, जो कि अक्सर COVID का प्रकटीकरण होता है। अस्पताल में भर्ती COVID के रोगियों में मूत्र कोशिका संरचना और अपग्रेडित मार्ग AKI वाले रोगियों की तुलना में AKI रहित रोगियों में काफी भिन्न होते हैं। . हम मूत्राशय की कोशिकाओं के सीधे संक्रमण के माध्यम से वायरल सिस्टिटिस के संभावित मामले का प्रारंभिक साक्ष्य भी प्रदान करते हैं। मूत्र कोशिकाओं का विश्लेषण गुर्दे की बीमारियों में होने वाले पैथोफिज़ियोलॉजी और सेलुलर परिवर्तनों को समझने के लिए एक उपयोगी अवसर प्रदान कर सकता है।

खुलासे

ए. अग्रवाल ने अकेबिया थेरेप्यूटिक्स (एकेआई के लिए हाइपोक्सिया-इंड्यूसिबल फैक्टर पाथवे के आधार पर नई चिकित्सा विज्ञान की समीक्षा करने के लिए एक विशेषज्ञ पैनल में काम किया), डायनेम्ड (डायनेम्ड के लिए एकेआई से संबंधित सामग्री की समीक्षा की और द्वारा तैयार की गई समीक्षा और अद्यतन सामग्री) के साथ परामर्श समझौते की रिपोर्ट दी। AKI विषयों के लिए गतिशील संपादकीय टीम), और रीटा फार्मास्यूटिकल्स (सलाहकार के रूप में कार्यरत); गोल्डीलॉक्स थेरेप्यूटिक्स, इंक. में स्वामित्व हित; जेनजाइम/सनोफी फैब्री फ़ेलोशिप पुरस्कार से अनुसंधान निधि; और अकेबिया थेरेप्यूटिक्स, एमोरी, दक्षिणी कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय और वेंडरबिल्ट से सम्मान। ए. अग्रवाल अमेरिकन जर्नल ऑफ फिजियोलॉजी-रीनल फिजियोलॉजी, किडनी इंटरनेशनल और लेबोरेटरी इन्वेस्टिगेशन के संपादकीय बोर्ड के सदस्य के रूप में वैज्ञानिक सलाहकार या सदस्यता की भी रिपोर्ट करते हैं; गोल्डीलॉक्स थेरेप्यूटिक्स, इंक. के सलाहकार बोर्ड के सदस्य के रूप में (न्यूयॉर्क स्थित एक कंपनी जो तीव्र किडनी रोग और सीकेडी के लिए नैनोटेक्नोलॉजी का उपयोग करके किडनी में दवाओं की डिलीवरी की जांच कर रही है); किडनी प्रिसिजन मेडिसिन प्रोग्राम के लिए एक बाहरी मूल्यांकन पैनल सदस्य के रूप में; और अल्फा यंग, ​​एलएलसी और एंजियन के सलाहकार बोर्ड के सदस्य के रूप में। शेष सभी लेखकों के पास बताने के लिए कुछ भी नहीं है।

अनुदान

इस कार्य को नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ डायबिटीज एंड डाइजेस्टिव एंड किडनी डिजीज अनुदान P30 DK079337 (ए. अग्रवाल को), R01 DK118932 (ए. अग्रवाल को), और R01 DK59600 (ए. अग्रवाल को) द्वारा समर्थित किया गया था; नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ एलर्जी एंड इंफेक्शियस डिजीज अनुदान T32 AI007051 (एमडी चेउंग को); नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ जनरल मेडिकल साइंसेज अनुदान टी32-जीएम-008361 (एमडी चेउंग को); अमेरिकन हार्ट एसोसिएशन अनुदान 827257 (एन एर्मन को); और एंडरसन इनोवेशन अवार्ड (जेएफ जॉर्ज को)।

स्वीकृतियाँ

लेखक मूत्र नमूनों के संग्रह और प्रसंस्करण में सहायता के लिए सुश्री वांडा हॉल, सुश्री राचेल शेविन और डॉ. चियाओ-वांग सन को धन्यवाद देते हैं; श्री रॉबर्ट जॉनसन और क्लिनिकल डेटा को संसाधित करने के लिए सेंटर फॉर क्लिनिकल एंड ट्रांसलेशनल साइंसेज (सीसीटीएस) इंफॉर्मेटिक्स फॉर इंटीग्रेटिंग बायोलॉजी और बेडसाइड (i2b2) टीम; डॉ. केटी बीन, डॉ. विन्न सी, डॉ. क्लेयर लायस, और गैर-कोविड-19 AKI मूत्र के संग्रह के लिए एक्यूट नेफ्रोलॉजी परामर्श टीम; मेहनती प्रूफरीडिंग के लिए डॉ. कैरोलिन केली; और प्रशासनिक सहायता के लिए डॉ. केली एंड्रिंगा और सुश्री मोज़ेला केर्ली। हम यूएबी फ्लो साइटोमेट्री और सिंगल सेल कोर (नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ हेल्थ [एनआईएच] अनुदान पी {{4}एआर - 04831), यूएबी हेफ्लिन जीनोमिक्स कोर (एनआईएच अनुदान 5पी30सीए 013148-48), और स्वीकार करते हैं। सीसीटीएस, नेशनल सेंटर फॉर एडवांसिंग

अनुवाद विज्ञान (NIH अनुदान UL1TR003096)।

लेखक का योगदान

एनबी एर्डमैन, ईएन एर्मन, जेएफ जॉर्ज, जी. गजर-रहीमी, एस. लियू और केएच मूर ने पांडुलिपि की समीक्षा और संपादन किया।

डेटा

साझा वक्तव्य

इस पेपर में उत्पन्न scRNAseq डेटा जीन एक्सप्रेशन ऑम्निबस में परिग्रहण संख्या GSE180595 के तहत उपलब्ध है। पूरक सामग्री इस आलेख में http://kidney360.asnjournals.org/lookup/suppl/doi:10.34067/ KID.0005522021/-/DCSupplemental पर ऑनलाइन निम्नलिखित पूरक सामग्री शामिल है। पूरक चित्र 1. प्रत्येक रोगी के नमूने से ली गई कोशिकाओं की विविधता। पूरक चित्र 2. एकेआई और बिना एकेआई नियंत्रण समूहों दोनों में हॉलमार्क मार्गों का जीन सेट संवर्धन विश्लेषण। पूरक चित्र 3. रोगी 7 की कोशिकाओं से विभेदित रूप से व्यक्त जीन का हीट मैप।

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