भाग 5: हिप्पोकैम्पस एनग्राम एन्सेम्बल में मेमोरी फॉर्मेशन और रिकॉल के दौरान एपिजेनोमिक और ट्रांसक्रिप्टोमिक इंटरप्ले का मानचित्रण

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विस्तारित डेटा चित्र 2: स्थिर डीएआर मुख्य रूप से एन्हांसर्स मार्क्स के लिए समृद्ध हैं

(ए) हिप्पोकैम्पस से विभिन्न न्यूरोनल आबादी के प्रवाह साइटोमेट्री विच्छेदन के लिए कार्यप्रवाह, के दौरानस्मृतिगठन और पुनर्प्राप्ति। सभी जनसंख्या (बाएं पैनल) की अभिव्यक्ति दिखाने वाले प्रतिनिधि FACS प्लॉट। आगे का चयन एकल नाभिक और न्यूरॉन प्लस / डीएपीआई प्लस जनसंख्या (मध्य पैनल) पर किया गया था। अंत में, चयन गेटेड उप-जनसंख्या पर किया गया था; GFP प्लस (सभी कोशिकाओं से ~ 2.5 प्रतिशत के लिए समायोजित), ARC प्लस / GFP प्लस (~ 0। सभी कोशिकाओं से .15 प्रतिशत), और नाभिक को 1.5 मिलीलीटर Eppendorf ट्यूबों में 1 प्रतिशत पीबीएस के 200ul के साथ लेपित किया गया था।

करने के लिए क्लिक करेसिस्टैंच एक्सट्रेक्ट पाउडर याददाश्त में सुधार करता है

(बी) वेन आरेख (बाएं) और तालिका (दाएं), अलग-अलग जोड़ीदार तुलनाओं में पहचाने गए डीएआर के बीच ओवरलैप का वर्णन करते हैंस्मृतिगठन और स्मरण।

(सी) क्रोमएचएमएम उत्सर्जन (मनाया गया) पर क्रोमेटिन राज्यों के संवर्धन सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण हैं या नहीं यह निर्धारित करने के लिए रेज़मैपलिंग-आधारित सांख्यिकीय विश्लेषण किया गया था। अपेक्षित संवर्धन की गणना 'सभी सुलभ साइटों' और 'सभी हिस्टोन संशोधन साइटों (यानी सभी उत्सर्जन)' लोकी के बीच ओवरलैप (क्रमपरिवर्तन) के 1 0, 000 यादृच्छिक सेटों को करके की गई थी और इसे हिस्टोग्राम के रूप में प्रस्तुत किया गया था। आंकड़ा। प्रत्येक यादृच्छिक सेट का एक नमूना आकार प्रत्येक राज्य से डीएआर के आकार द्वारा निर्धारित किया गया था। नमूने के माध्य और मानक विचलन की गणना की गई (पूरक तालिका 3)। डीएआर और प्रत्येक उत्सर्जन के बीच देखे गए ओवरलैप की संख्या की गणना की गई और इसे लाइनों के रूप में प्रस्तुत किया गया। z-स्कोर की गणना परती के रूप में की गई थी; Z=(प्रेक्षित मान (X) - नमूने का माध्य (μ))/(नमूने का मानक विचलन (σ))। जेड-स्कोर बेसल बनाम अर्ली; एसई 10.5, हम 6.9। स्थिर; एसई 16.9, हम 12.7, सभी पी <0.0001, जेड-स्कोर="" अर्ली="" बनाम="" लेट;="" एसपी="" 91.7,="" डब्ल्यूपी="" 38.7।="" देर="" से="" बनाम="" पुन:="" सक्रिय;="" एसपी="" 26.8,="" डब्ल्यूपी="" 28.9,="" सभी=""><0.0001. p-values="" (two-sided)="" were="" calculated="" from="" the="" z-table.="" a="" full="" analysis="" is="" reported="" in="" supplement="" table="">

(डी) पाई चार्ट सभी स्थिर क्षेत्रों के लिए विभिन्न वर्धक राज्यों का प्रतिशत दर्शाता है। प्रत्येक स्थिर क्षेत्र का ओवरलैप पहले प्रकाशित H3K4me1 और H3K27ac चिप-सीक्यू डेटा के साथ किया गया था, जिसे FS21 के बाद 1h प्राप्त किया गया था। एन्हांसर्स राज्यों को 'प्राइमेड' के रूप में वर्गीकृत किया गया था - केवल H3K4me1, 'सक्रिय' के साथ चिह्नित क्षेत्रों के साथ ओवरलैप - H3K4me1 / H3K27ac या 'अव्यक्त' के साथ - कोई ओवरलैप नहीं।

(e) Motifs identified from nucleosome-free regions (NFR) on the ATAC-seq tracks from each state (Basal, Activated -early, Activated -late, and Reactivated). Peaks were divided into positions that were annotated to promoters (5kb from TSS) and enhancers (>टीएसएस से 5kb)। वृत्त का आकार संवर्धन के प्रतिशत (1-50 प्रतिशत) को दर्शाता है। रंग इंगित करता है -लॉग (पी-वैल्यू)।

विस्तारित डेटा चित्र 3: के दौरान एपिजेनेटिक अवस्था का समन्वित प्राइमिंगस्मृतिएन्कोडिंग और

(ए) प्रत्येक चरण में शिकागो-पहचाने गए इंटरैक्शन के गुण (बेसल, सक्रिय-प्रारंभिक, सक्रिय-देर से, और पुन: सक्रिय)। महत्वपूर्ण इंटरैक्शन कॉलिंग में डिफ़ॉल्ट सेटिंग्स और 5 के स्कोर थ्रेशोल्ड का उपयोग किया गया था, सभी प्रतिकृति पर संयुक्त रूप से प्रदर्शन किया गया था।

(बी) पाई चार्ट शिकागो द्वारा खोजे गए सभी इंटरैक्शन के प्रतिशत का प्रतिनिधित्व करता है जो H3K27ac/H3K4me1 (67.5 प्रतिशत बढ़ाने वाले अंक), H3K4me3/H3K9ac (46.2 प्रतिशत प्रमोटर मार्क), या H3K27me3 (1.1 प्रतिशत दमनकारी अंक) द्वारा सीमांकित हैं।

( c ) वाशू एपिजेनोम ब्राउज़र इमेज, जिसमें Eif4e2 जीन के आसपास ~ 500 Kb क्षेत्र शामिल है। आर्क महत्वपूर्ण सामान्य (लाल आयत) और अद्वितीय (तीर) बढ़ाने वाले दिखाते हैं जो प्रमोटरों (नीला आयत) के साथ बातचीत करते हैं।

(डी) शिकागो द्वारा बुलाए गए इंटरैक्शन के उदाहरण। 500–700 kb (अपस्ट्रीम और डाउनस्ट्रीम) ग्रिंक3 और Wwc2 प्रमोटर। शिकागो द्वारा पता लगाए गए महत्वपूर्ण इंटरैक्शन (स्कोर 5 से अधिक या उसके बराबर) लाल रंग में दिखाए जाते हैं, और सब-थ्रेसहोल्ड इंटरैक्शन (स्कोर <5 से="" कम="" या="" बराबर)="" नीले="" रंग="" में="" दिखाए="" जाते="" हैं।="" धूसर="" रेखाएं="" अपेक्षित="" गिनती="" दिखाती="" हैं="" और="" धराशायी="" रेखाएं="" 95="" प्रतिशत="" विश्वास="" अंतराल="" की="" ऊपरी="" सीमा="" दिखाती="" हैं।="" (ई)="" 1="" 0,="" 000="" सुलभ="" साइटों="" के="" यादृच्छिक="" सेट="" पर="" क्रमपरिवर्तन="" प्रक्रिया="" का="" उपयोग="" करके,="" इंटरैक्टिंग="" एन्हांसर="" और="" डीएआर="" के="" बीच="" ओवरलैप="" संवर्धन="" विश्लेषण।="" हिस्टोग्राम="" प्रत्येक="" स्थिति="" के="" लिए="" सुलभ="" साइटों="" का="" यादृच्छिक="" नमूना="" वितरण="" प्रस्तुत="" करता="" है="" (बेसल="" बनाम="" सक्रिय="" -="" प्रारंभिक,="" सक्रिय="" -="" प्रारंभिक="" बनाम="" सक्रिय="" -="" देर="" से,="" सक्रिय="" -="" देर="" से="" बनाम="" पुन:="" सक्रिय,="" स्थिर)।="" ओवरलैप्ड="" लोकी="" की="" संख्या="" बेसल,="" एक्टिवेटेड-अर्ली,="" एक्टिवेटेड-लेट="" और="" रिएक्टिवेटेड="" न्यूरॉन्स="" से="" रंगीन="" लाइनों="" में="" प्रस्तुत="" की="" जाती="" है।="" बीएएस="" बनाम="" सक्रिय-प्रारंभिक="" (जेड-स्कोर;="" 7.1,="" 7.7,="" 8.5,="" 10.9)="" के="" डीएआर।="" सक्रिय-प्रारंभिक="" बनाम="" सक्रिय-लेट="" (z-score;="" −0.1,="" −0.8,="" −2.4,="" −3.2)="" के="" dars।="" सक्रिय-देर="" से="" बनाम="" पुन:="" सक्रिय="" (0.4,="" 1.8,="" 0.4,="" −0.2)="" के="" डीएआर।="" स्थिर="" के="" डीएआर="" (जेड-स्कोर;="" 1.7,="" 2.0,="" 6.5,="">

विस्तारित डेटा चित्र 4: प्रारंभिक चरण के दौरान होने वाले क्रोमैटिन परिवर्तन सक्षम करते हैं

(ए) जोड़ी-वार अंतर विश्लेषण से जीन नामों के बीच ओवरलैप विश्लेषण और i) सक्रिय डीजी ग्रेन्युल कोशिकाओं 1 एच उपन्यास एक्सपोजर के बाद 32 ii) एफएस20 के बाद 24 घंटे और iii) माउस संवर्धित कॉर्टिकल के लंबे समय तक उत्तेजना (6 एच) के बाद KCl33 के साथ न्यूरॉन्स। विश्लेषण GeneOverlap R पैकेज द्वारा किया गया था।

(बी) एक्सोनिक (लाल) और पुरानी (नीला) रीड्स को सभी स्थितियों में अलग-अलग मात्रा में निर्धारित किया गया था और DEseq2 द्वारा मापी गई ट्रांसक्रिप्शनल गतिविधि की तुलना में। रीड्स को सामान्यीकृत किया गया (RPKM) और प्रत्येक राज्य के लिए log2FC परिवर्तन प्रस्तुत किए गए हैं। वायलिन प्लॉट माध्य इंगित करता है,

इंटरक्वेर्टाइल रेंज, और न्यूनतम और अधिकतम, वन-वे एनोवा (पैरामीट्रिक, अनपेयर्ड), बेसल बनाम अर्ली; एफ (5, 248)=389.9. जल्दी बनाम देर से; एफ (5, 2374)=2183। देर से बनाम पुन: सक्रिय। एफ (5, 1357) {{10}}.5, सभी पीएस < 0.0001।="" बोनफेरोनी="" की="" कई="" तुलनाएँ।="" एनएस="गैर-महत्वपूर्ण," ***पी=""><>

(सी) प्रत्येक क्लस्टर में सभी स्थितियों (लॉग 2 एफसी स्केल) में एक्सॉन/इंट्रोन अनुपात मापा गया था। वायलिन प्लॉट माध्य, इंटरक्वेर्टाइल रेंज और न्यूनतम और अधिकतम, एकतरफा एनोवा (पैरामीट्रिक, अयुग्मित), एफ (5, 1143)=260.2, पी को इंगित करता है।<0.0001. bonferroni's="" multiple="" comparisons="" test.="" n.s="non-significant," ***p="" <="">

(डी) अलग-अलग अवधि के दौरान डीएआर और डीईजी के बीच ओवरलैप विश्लेषणस्मृतिचरण इंटरजेनिक और इंट्रोन्स क्षेत्रों पर डीएआर को पीसी-एचआईसी इंटरेक्शन मैप्स के साथ उनके संबंधित जीन में मैप किया गया था। ओवरलैप विश्लेषण GeneOverlap R पैकेज द्वारा किया गया था। फिशर के सटीक परीक्षण से पी-वैल्यू (संख्या) और ऑड्स अनुपात (रंग) हीटमैप में प्रस्तुत किए जाते हैं। एनएस - महत्वपूर्ण नहीं।

(ई) डीएआर के लॉग 2एफसी मूल्यों और लॉग 2एफसी डीईजी के बीच पियर्सन सहसंबंध जो उस क्षेत्र के लिए एनोटेट किए गए थे (पीसी-एचआईसी डेटा सेट के माध्यम से इंटरजेनिक क्षेत्रों को मैप किया गया था)। Desq2 (ग्रे लाइन) द्वारा मापा गया क्रोमैटिन एक्सेसिबिलिटी परिवर्तनों की तुलना पार्स किए गए एक्सोनिक रीड्स (रेड लाइन), इंट्रॉनिक रीड्स (ब्लू लाइन्स), और टोटल ट्रांसक्रिप्शनल चेंजेस (दोनों इंट्रॉनिक और एक्सोनिक रीड्स) से की गई। सभी r और p-मान अनुपूरक तालिका 9 में बताए गए हैं।

विस्तारित डेटा चित्र 5: सक्रिय-देर से न्यूरॉन्स में ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तन उच्च सहसंबद्ध हैं

(ए) एक्सोनिक (लाल) और पुरानी (नीला) रीड्स को अंजीर 5बी में पहचाने गए प्रत्येक क्लस्टर के लिए सभी स्थितियों में अलग-अलग मात्रा में निर्धारित किया गया था। रीड्स को सामान्यीकृत किया गया (RPKM) और प्रत्येक क्लस्टर के लिए log2FC परिवर्तन प्रस्तुत किए गए हैं।

(बी) प्रत्येक क्लस्टर में सभी स्थितियों में एक्सॉन / इंट्रॉन अनुपात मापा गया। वायलिन प्लॉट माध्य, इंटरक्वेर्टाइल रेंज और न्यूनतम और अधिकतम, n=3 जैविक रूप से स्वतंत्र नमूने वन-वे एनोवा (पैरामीट्रिक, अनपेयर), ड्व-लेट क्लस्टर को इंगित करता है; एफ (3, 968)

652) = 93.97, P<0.0001. reactivation="" -cluster;="" f="" (3,="" 1600)="485.2,"><0.0001. bonferroni's="" multiple="" comparisons="" test="" to="" deseq2="" reads.="" ***p="" <="">

विस्तारित जानकारी अंजीर। 6: अलग अस्थायी ट्रांस्क्रिप्शनल कार्यक्रमों हैं प्राणी सिंक्रनाइज़ प्रति

टेमोक्सीफेन की उपस्थिति में एक आश्रित तरीके से। दाएँ फलक में, DG के प्रतिनिधि IHC चित्र। हरा - AAV-eYFP, लाल - अंतर्जात चाप। स्केल बार 50 माइक्रोन का प्रतिनिधित्व करता है।

(बी) अलग-अलग के दौरान रीढ़ की आकृति विज्ञान का आकलनस्मृतिचरण दायां पैनल विभिन्न प्रकार के स्पाइन (स्टब्बी, थिन, मशरूम, बढ़े हुए मशरूम) के साथ एक एकल ईवाईएफपी प्लस डेंड्रिटिक शाफ्ट दिखाता है। स्केल बार 5 माइक्रोन का प्रतिनिधित्व करता है। बॉक्सप्लॉट माध्य, इंटरक्वेर्टाइल रेंज और न्यूनतम और अधिकतम, सक्रिय-प्रारंभिक: n=4 चूहों /5 अनुभाग प्रति पशु, सक्रिय-देर: n=4 चूहों /4 अनुभाग प्रति पशु, पुन: सक्रिय: n को इंगित करता है।=4 चूहे / 2 खंड प्रति जानवर। वन-वे एनोवा (पैरामीट्रिक, अनपेयर्ड), स्टब्बी; एफ (2, 36)=2.313, पी=0.1135। पतला; एफ (2, 36)=35.12, पी<0.0001. mushroom;="" f="" (2,="" 36)="38.42," p="" <="" 0.0001.="" bonferroni's="" multiple="" comparisons="" test,="" ***p="" <="">

(सी) प्रतिनिधि आईएचसी छवियां और ईआईएफ परिवार के दो सदस्यों के प्रोटीन स्तर की मात्रा का ठहराव; (बाएं) Eif2a और (दाएं) Eif3e। स्केल बार 10 माइक्रोन का प्रतिनिधित्व करता है। वृक्ष के समान शाफ्ट के लिए डेटा संख्या और लंबाई (μM) के बीच अनुपात के रूप में प्रस्तुत किया जाता है। n=4 चूहों /5 खंड प्रति जानवर, बॉक्सप्लॉट माध्य, इंटरक्वेर्टाइल रेंज और न्यूनतम और अधिकतम, एकतरफा एनोवा (पैरामीट्रिक, अनपेयर) को बोनफेरोनी के कई तुलना परीक्षण के साथ इंगित करता है, एनएस - महत्वपूर्ण नहीं, Eif2a दस्ता; एफ (2, 20)=4.484, पी=0.0246। सोमा; एफ (2, 21)=19.58, पी <0.0001। (सक्रिय="" -="" अर्ली="" बनाम="" एक्टिवेटेड="" -लेट="" *p="0.0142," एक्टिवेटेड="" -अर्ली="" बनाम="" रिएक्टिवेटेड="" *p=""><0.0001, एक्टिवेटेड-लेट="" बनाम="" रिएक्टिवेटेड="" *p="0.0303)।" eif3e="" दस्ता;="" एफ="" (2,="" 14)="1.983," पी="0.1745।" सोमा;="" एफ="" (2,="" 23)="8.309," पी="0.0019," (सक्रिय-जल्दी="" बनाम="" पुन:="" सक्रिय="" *पी="0.0057," सक्रिय-देर="" बनाम="" पुन:="" सक्रिय="" *पी="" {{="">

(डी) पाई चार्ट सक्रिय-लेट और रिएक्टिवेटेड न्यूरॉन्स से बढ़े हुए मशरूम स्पाइन (3 डीएन से अधिक या बराबर) और मशरूम स्पाइन का प्रतिशत प्रस्तुत करता है।

(ई) विभिन्न चरणों के दौरान, ग्रिआ1 एमआरएनए स्तरों के प्रतिनिधि चित्र (बाएं पैनल) और परिमाणीकरण (दाएं पैनल)स्मृति. डेटा को कई पंक्टा और वृक्ष के समान शाफ्ट लंबाई के बीच अनुपात के रूप में प्रस्तुत किया जाता है। स्केल बार 10 माइक्रोन का प्रतिनिधित्व करता है। एन=4 चूहों /5 खंड प्रति जानवर, बॉक्सप्लॉट माध्य, इंटरक्वेर्टाइल रेंज और न्यूनतम और अधिकतम, दस्ता को इंगित करता है; वन-वे एनोवा (पैरामीट्रिक, अनपेयर्ड) एफ (2, 15)=10.41, पी=0.0015। बोनफेरोनी का बहु तुलना परीक्षण, **P=0.0011. निचला पैनल - सोमा; वन-वे एनोवा एफ (2, 12)=0.13, पी=0.88।

विस्तारित डेटा चित्र 7: अलग-अलग कॉम्बिनेटरियल एन्हांसर्स के साथ बातचीत एक दिशा की ओर ले जाती है

(ए) वेन आरेख सभी में क्रोमेटिन एक्सेसिबिलिटी (डीएआर) के बीच ओवरलैप का प्रतिशत दिखाते हैंस्मृतिचरण (बीएएस बनाम सक्रिय - प्रारंभिक, हल्का हरा ग्रिड सर्कल; सक्रिय - प्रारंभिक बनाम सक्रिय - देर से, गहरा हरा ग्रिड सर्कल; सक्रिय - देर से बनाम पुन: सक्रिय, नारंगी ग्रिड सर्कल) और सभी पहचाने गए समूहों से कुल ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तन (डीडब्ल्यू - लेट, अप-लेट, स्टेबल, रिएक्टिवेशन, ब्लू ग्रिड सर्कल)। इंटरजेनिक और इंट्रोन्स डीएआर को पीसी-एचआईसी इंटरेक्शन मैप्स के साथ उनके संबंधित जीन में मैप किया गया था। ओवरलैप के प्रतिशत की गणना समूहों में सभी पहचाने गए डीईजी (n=1095) से की गई थी।

(बी) प्रत्येक क्लस्टर से डीएआर (जोड़ीवार) और डीईजी के बीच ओवरलैप विश्लेषण। इंटरजेनिक और इंट्रोन्स डीएआर को पीसी-एचआईसी इंटरेक्शन मैप्स के साथ उनके संबंधित जीन में मैप किया गया था।

ओवरलैप विश्लेषण GeneOverlap R पैकेज द्वारा किया गया था। फिशर के सटीक परीक्षण से पी-मान और जैककार्ड मान (रंग) हीटमैप (बाएं) पर प्रस्तुत किए जाते हैं। ओवरलैप के प्रतिशत की गणना समूहों (दाएं) में सभी पहचाने गए डीईजी से की गई थी।

( c ) क्रोमेटिन की प्रतिनिधि छवि और Dw-लेट क्लस्टर से Gabrb3 ठिकाने के ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तन। जबकि प्रारंभिक राज्य बातचीत ट्रांसक्रिप्शनल एक्टिवेटर (एपी 1) के साथ प्रमोटर और एन्हांसर के बीच थी, देर से राज्य की बातचीत ट्रांसक्रिप्शनल रिप्रेसर्स (स्लग) के साथ थी। ऊपरी IGV जीनोम ब्राउज़र ट्रैक (बैंगनी - बेसल, हल्का हरा - सक्रिय - प्रारंभिक, गहरा हरा - सक्रिय - देर से और नारंगी - पुन: सक्रिय) वर्तमान ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तन (ncRNA-seq), मध्य ट्रैक क्रोमैटिन एक्सेसिबिलिटी डायनेमिक्स (ATAC-seq) दिखाते हैं। प्रमोटर (लाल आयत) और बढ़ाने वाले (ग्रे आयत)। महत्वपूर्ण प्रमोटर-एन्हांसर इंटरैक्शन को आर्क्स (वॉशयू ब्राउजर ट्रैक्स) के रूप में दर्शाया जाता है। लोअर ट्रैक प्रेजेंट मोटिफ्स जिन्हें होमर टूल्स (स्लग, एपी 1, और रेस्ट) के माध्यम से पहचाना गया था।

(डी) व्यक्तिगत रूपांकनों के लिए एकत्रीकरण भूखंड। प्रत्येक क्लस्टर से चोटियों के केंद्र (-/ प्लस 4000bp) के आसपास छह चयनित रूपांकनों (दो दमनकारी, दो सक्रियकर्ता, और दो द्विसंयोजक) के संवर्धन मूल्यों (प्रति बीपी / प्रति शिखर) का मूल्यांकन किया गया था।

विस्तारित डेटा चित्र 8: क्रोमैटिन एक्सेसिबिलिटी का प्रस्तावित मॉडल, प्रमोटर-एन्हांसर इंटरैक्शन, और हिप्पोकैम्पस मेमोरी एनग्राम न्यूरॉन्स की ट्रांसक्रिप्शनल डायनेमिक्स

क्षेत्र, जो ट्रांसक्रिप्शनल एक्टिवेटर रूपांकनों को परेशान करते हैं। इस प्रमोटर-एन्हांसर रिप्रोग्रामिंग के परिणामस्वरूप जीन की अभिव्यक्ति में वृद्धि होती है जो संभवतः के स्थिरीकरण की अनुमति देता हैस्मृति. याद करें - पुन: सक्रिय किए गए एनग्राम न्यूरॉन्स ने प्राइमेड प्रमोटर-एन्हांसर इंटरैक्शन के एक सबसेट का उपयोग किया, जो कि एमआरएनए ट्रांसपोर्ट में सिनैप्टिक डिब्बों और प्रोटीन अनुवाद में शामिल ट्रांसक्रिप्शनल परिवर्तनों से जुड़ा है। ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर - टीएफ, ई (1–3) - अलग-अलग एन्हांसर जो एक ही प्रमोटर के साथ इंटरैक्ट करते हैं, रेड - ट्रांसक्रिप्शनल रिप्रेसर्स, ब्लू - ट्रांसक्रिप्शनल एक्टिवेटर।

पूरक सामग्री

पूरक सामग्री के लिए पबमेड सेंट्रल पर वेब संस्करण देखें।

स्वीकृतियाँ

हम उपयोगी चर्चा और सुझावों के लिए ई. निडर्स्ट, जे. पेनी, एस. बार्कर, आरटी स्टॉट, एम. विक्टर, ए. वाटसन, एन. डेडिक, ई. लॉकशिन और एल.एचटी लैब के सदस्यों को धन्यवाद देते हैं। चूहों कॉलोनी रखरखाव के लिए हम प्रयोगशाला प्रबंधकों वाई झोउ, ई मैकनामारा को धन्यवाद देते हैं। हम FACS में मदद के लिए पी. ऑटिसियर (व्हाइटहेड इंस्टीट्यूट) को धन्यवाद देते हैं। अनुदान: इन कार्यों को NIH अनुदान RF1AG062377, AF1AG054012, RO1NS102730, RF1AG064321, द जेपीबी फाउंडेशन, द अलाना डाउन सिंड्रोम रिसर्च फाउंडेशन, द लुमाइंड डाउन सिंड्रोम रिसर्च फाउंडेशन, क्योर अल्जाइमर फंड सर्किट कंसोर्टियम, और रॉबर्ट ए और रेनी ई द्वारा समर्थित किया गया था। बेलफ़र फ़ैमिली फ़ाउंडेशन से LH.T. इस कार्य को आंशिक रूप से NIH अनुदान R01AG058002, U01NS110453, R01AG062335, UG3NS115064 से MK और LH.T, और R01AG067151, R01MH109978, U01MH119509, R01HG008155, U24HG009446 से MKVD द्वारा समर्थित {28} AARF द्वारा समर्थित है {28}} . एचएसएम को बरोज़ वेलकम फंड और यूएनसीएफ-मर्क पोस्टडॉक्टरल फेलोशिप द्वारा समर्थित है। C. A को JPB फाउंडेशन का समर्थन प्राप्त है। RMR NIH T32 ग्रांट 5T32HD09806 द्वारा समर्थित है। हाई-सी लाइब्रेरी तैयारी किट डोवेटेलटीएम (v.1.03, डोवेटेल जीनोमिक्स, शिकागो, यूएसए) से एक उदार उपहार के रूप में प्राप्त हुई थी। हम उपयोगी चर्चा और सुझावों के लिए डोवेटेल टीम को धन्यवाद देते हैं।